Có một vấn đề đáng lưu tâm ở đây đó là S-400 được các công trình sư người Nga thiết kế như một hệ thống phòng không đa tầng chứ không chỉ chuyên về đánh tầm cao, bằng chứng là nó vẫn mang được đạn đánh chặn 9M96 chuyên đánh tầm thấp trên cùng một xe mang phóng tự hành, bên cạnh các loại đạn 48N6 hay 40N6.

Tên lửa đánh chặn 9M96 tích hợp trên xe mang phóng tự hành của S-400 Triumf
Nhưng mới đây trên các trang quân sự của Nga đã đăng tải hình ảnh về một xe mang phóng tự hành 51P6 của tổ hợp S-400 Triumf mang 4 ống chứa đạn 9M96 tại vị trí của một ống 48N6, cho thấy Moskva bắt đầu tái trang bị khả năng đánh thấp cho S-400.
Hành động này của Nga có thể là do họ muốn nâng cao tính đa năng cho S-400, giảm sự phụ thuộc vào Pantsir-S1, đi kèm với đó là bố trí lại đội hình chiến đấu theo hướng tinh gọn, giảm bớt sự cồng kềnh của các tổ hợp phòng không cận vệ đi kèm.