Hai năm sau, Việt Nam và Indonesia lại gặp nhau trong trận giao hữu quốc tế hồi tháng 10-2016 trên sân Maguwoharjo ở thành phố Yogyakarta của Indonesia. Với sự chỉ đạo nghiêm khắc của HLV Nguyễn Hữu Thắng, Việt Nam triển khai thế trận phòng ngự - phản công đã nhanh chóng áp đảo chủ nhà và có hai bàn thắng dẫn trước từ rất sớm do công của tuyển thủ Lê Văn Thắng và Vũ Minh Tuấn. Nhưng một lần nữa 'Rồng vàng' bị gỡ hòa đáng tiếc 2-2 ở thời gian trong trận cầu có 4 siêu phẩm bàn thắng!
Tháng 11-2016, cũng trong một trận cầu giao hữu quốc tế trước thềm AFF Cup 2016, người hâm mộ bóng đá Đông Nam Á mãn nhãn khi chứng kiến màn trình diễn đỉnh cao giữa chủ nhà Việt Nam và Indonesia. Nòng cốt tuyển Việt Nam khi ấy là sự pha trộn giữa sức trẻ và kinh nghiệm của những 'lão tướng'. Màn ngược dòng giành chiến thắng 3-2 đẹp mắt trước Indonesia trong 'cơn mưa' bàn thắng của Việt Nam khiến khán giả trên sân Mỹ Đình lúc ấy vỡ òa cảm xúc. Đó cũng là lần đầu tiên cựu tuyển thủ quốc gia Nguyễn Hữu Thắng vượt qua ông thầy Alfred Riedl của mình trong cương vị huấn luyện viên.
Ở lượt trận bán kết AFF Cup 2016, Indonesia đã đòi được cả gốc lẫn lãi món nợ thua Việt Nam trước đó tại Mỹ Đình. Lượt đi trận bán kết, thầy trò HLV Riedl tận dụng sai lầm nơi hàng thủ đối phương để giành chiến thắng kịch tính 2-1 trên sân nhà Pakansari, trước khi may mắn cầm hòa Việt Nam 2-2 trên sân Mỹ Đình trong trận bán kết lượt về. Qua đó Indonesia giành chiến thắng chung cuộc 4-3 và lấy suất vào chung kết gặp Thái Lan, rồi giành ngôi á quân chung cuộc.
Từ AFF Cup 2016 đến nay, bóng đá Indonesia rơi vào sự bế tắc và luôn nhận những thất bại nặng nề bởi sa sút phong độ lẫn yếu kém về kỹ năng, chiến thuật. Trong khi đó, người láng giềng Việt Nam dưới bàn tay HLV Park Hang-seo đã có cuộc đổi thay mạnh mẽ và liên tục gặt hái thành công ở những sân chơi trong khu vực lẫn châu lục.